ציפרלקס שייך לקבוצת הקינולונים ויש לו השפעה אנטיבקטריאלית נגד אנטרובקטר, Pseudomonas aeruginosa, Haemophilus influenzae, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus, Legionella ו-Staphylococcus aureus.לציפרלקס יש פעילות אנטיבקטריאלית רחבת טווח ואפקט חיידקי טוב.הפעילות האנטיבקטריאלית של כמעט כל החיידקים חזקה פי 2 עד 4 מזו של נורפלוקסצין ואנוקסצין.